Le père de Yato et Nora tente de semer la discorde entre Yato, Yukine et Hiyori par tous les moyens.
Pendant ce temps, Bishamon et Tenjin poursuivent leurs enquêtes sur le vrai mage.
Chacun découvre l’existence d’un mystérieux "Père".
Hiyori, en se questionnant sur le "Secret des dieux", est projetée dans les souvenirs de Yato.
Elle découvre alors un épisode sombre de son passé.